O Ensino Médio tem como proposta propiciar ao aluno o contato mais amplo possível com todas as áreas do conhecimento e suas habilidades, confirmadas nas práticas de seu autoconhecimento, direcionando seus estudos às escolhas para o futuro: uma universidade, uma profissão, uma carreira.

O Colégio Madre Cecília desenvolve um trabalho de preparação do aluno para prestar as principais provas e vestibulares, possibilitando seu ingresso nas melhores instituições de ensino superior do país. O Colégio tem como meta formar cidadãos responsáveis, capazes de solucionar problemas, através do aprendizado que adquiriram durante o processo de formação, preparando-os para a vida adulta. O acolhimento e o envolvimento com a escola, os professores e todo o processo de aprendizagem é uma marca reconhecida e um fator determinante na sua formação.